在表觀遺傳學研究中，尋找轉錄因子的調控位點是困擾科學家的難題，經典的ChIP-seq技術存在很多弊端，最主要的是抗體問題，對于非模式植物更難入手。與ChIP-seq相比，DAP-seq將蛋白質體外表達技術與高通量測序技術相結合，不需要針對每個轉錄因子制備特異性抗體，所以DAP-seq具有快速、高通量、節約時間成本等顯著優勢。

DAP-seq是研究非模式植物順反組和表觀組的有力技術，大大擴展和加深了科學家們研究的轉錄因子結合位點信息。它能夠捕獲全部轉錄結合位點，因此能獲得完整的密碼本。并且，DAP-seq無需復雜和專門的實驗設備，這種方法可用于所有模式或非模式植物。這為我們提供了一扇窗口，來發現調控序列中表觀遺傳變異影響植物性狀的機制。

DAP-seq實驗流程：

構建體外蛋白表達載體→體外蛋白表達→DNA文庫構建→親和純化→上機測序